非淋菌性尿道炎有复发的可能。复发的原因主要有两条：一、尿道是一个有很多腺体的管道，在这些腺体中通常会藏匿着某些顽固致病菌，导致泌尿系感染或易再次感染；二、由于细菌逐渐形成了较高的耐药性，尤其在中国非常高发，甚至常见的有对喹诺酮类非淋菌性尿道炎复发耐药的细菌非淋菌性尿道炎复发。喹诺酮类是泌尿系感染首选的抗生素，但在中国可能有百分之四十甚至更高的患者对喹诺酮耐药，因此可导致尿道炎易复发。所以临床上通常会根据患者所在医非淋菌性尿道炎复发院的病菌的流行病学情况，选择合适的抗生素，适当延长使用抗生素的时间，进一步减少尿道炎复发的可能。